研究表明,MYC对磷脂酰肌醇(PI)代谢具有组织特异性。作者通过空间代谢组学检测到RCC和T-ALL中,MYC可逆地降低了PI;但在LC和HCC中,MYC反而增加了这些物质(图 7)。可能是由于肺表面富含PG和PI,MYC才会增加了LC中的PI含量。作者推断,MYC通常能够增加PGs含量,但以组织特异性方式差异调节其他GPs,如PIs。***作者对脂肪生成在MYC诱导的**发生中的作用进行了探究,通过空间代谢组学、IHC和Western Blot等方法证明通过体外抑制FA合成可以抑制MYC诱导的脂肪生成,从而抑制了RCC、HCC和BCL的增殖(图 8)。空间代谢组通过质谱成像技术。河南药物空间代谢组学
空间代谢组学探究MYC、SREBP1与**发生的能量机制探索。斯坦福大学Dean W. Felsher课题组在Cell Metabolism发表的题为“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果,通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制,发现MYC与胆固醇调节元件结合蛋白(SREBP1)协同调节脂质生成,从而促进疾病的发生。中文标题:MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象:小鼠海南空间代谢组学在医学谁还在盘点空间代谢组学专题?4篇,总IF:82,篇篇经典~。
本研究应用空间代谢组学能够客观地识别食管腺*。EA组磷脂富含长链、多不饱和的PGs。并且,遗传学研究表明,这一机制与脂肪酸从头合成有关。这些结果表明,空间代谢组学可以区分恶性食管中的组织类型。在临床应用包括客观诊断和术中切缘评估具有潜在价值。在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已经完成共计近千例样本经验,包括心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等十几种组织样本空间代谢组学检测及分析。
在空间上的代谢变化表明,在东莨菪碱***后,大鼠脑微区的代谢网络发生紊乱。但是代谢物和代谢酶是代谢网络的关键因素,基于空间分辨的代谢组学信息为发现酶或基因异常提供了线索,但若要完成完整的代谢网络分析必须进一步验证蛋白质和基因表达水平。本文作者开发了一种空间分辨代谢网络作图方法,通过无需衍生化、特定标记或复杂样品预处理的高通量AFADESI-MSI方法和代谢组学策略,在具有复杂结构化脑组织中发现代谢分子变化。能检测出多种极性内源性代谢物,并绘制相关代谢网络,提供组织微区分布的图谱。还将多种功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神经酰胺代谢物)含量分布可视化。鹿明生物是国内早期推出AFADESI-MSI空间代谢组技术服务的先导者。
通过空间代谢组学测量了四种转基因小鼠模型(肺*(LC)、RCC、HCC和T-ALL)中甘油磷脂(GPs)的含量,发现在不同的**中,MYC诱导改变了磷酸酰甘油(PGs)的丰度(图 4A),能够增加了大多数PG物质。MYC失活后,PG丰度恢复到基础水平(图 4B)。PGs由磷脂酸(PA)通过向3-磷酸甘油中添加两种FA形成,因此,PG诱导可以建立在MYC促进的FA增加的基础上。然而,在体内PGs相对于其他GPs的相对优先合成,这意味着MYC有除FA合成之外的其他方式调节脂肪生成。空间代谢组学找出其代谢物的差异,提供定量检测。
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1.样本准备Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射东莨菪碱后被杀死(处理组,3只),对照组大鼠(3只)也用同样方法杀死。获取大鼠整个大脑,在低温下将大脑切成连续的矢状切片(暴露出海马和纹状体),用于Nissl染色、H&E染色和质谱成像检测。2.空间代谢组实验使用AFADESI-MSI分析,代谢物质量数范围50-500Da,质谱分辨率70,000。3.数据处理和代谢网络分析原始数据经过转化,再使用自建MassImager软件获取成像结果;在获取差异代谢物的高分辨率质谱信息后,使用Metaboanalys在线数据挖掘软件以褐家鼠(rattusnorvegicus)为参考完成代谢物高通量定性,并输出代谢网络信息。大脑中复杂网络可视化使用Cyctoscope软件完成。河南药物空间代谢组学
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